水质是水培栽培的重要决定因素。水是水培法的基本“载体”，因为它溶解并为植物输送营养。但是，水也会溶解很多对植物有害的杂质。这些杂质不易在视觉上检测到，而且很容易被误导为根据样品的澄清度对水的纯度做出错误的假设。水质差会导致许多植物生长问题，包括生长发育迟缓，矿物质毒性或缺乏症状，植物组织中有害元素的积累，细菌污染等。
然后，干净的水对于健康的植物生长至关重要。只要正确识别水质问题，通常就很容易解决。的方法是对水质保持积极态度，因为基于水的清晰度，不存在可见污染物等假设可能会产生误导。
水质参数
在水培法培养中，不同的污染物会干扰植物的发育：- 氯和氯胺
营养液中的氯和氯胺已知会损害几种作物，尤其是对敏感作物，如生菜，色拉蔬菜，草莓等。设置在反渗透膜上游的活性炭可以有效地去除那些氧化剂。
- 细菌和病原体
来自井，池塘溪流等来源的水通常含有生物，在将水用于营养制剂之前应将其清除。这些“病原体”中zui常见的是腐霉菌，当存在足够的孢子浓度时，它们会攻击植物。此外，细菌会释放离子和有机物，这可能对植物的生长有害。建议降低细菌和其他微生物的水平。
- 矿物质
水是一种的溶剂，能溶解包括矿物质在内的多种物质。尽管其中一些是有益的，但其他一些例如钠却非常有害。如果水中存在植物，即使少量也不会引起问题，它们不需要钠和氯化钠。钠可能非常有害，尤其是在再循环系统中。植物对钠的敏感性差异很大。
各种水源中的水中都可能存在镁，钙，钾，硫，硝酸盐和微量元素，例如硼，铜，锰和锌。在大多数情况下，可以通过适当调整营养配方以考虑到这些元素的存在来解决这一问题，从而防止供水中的积累和毒性。
为了确保在选择用于养分制备的高纯水中没有钠，钙，镁等矿物质存在，建议降低这些离子的浓度。使用反渗透降低自来水的总离子浓度（消除> 90％离子）可确保合适的离子浓度。
- 铁和铁细菌
氢氧化铁形式的铁通常存在于铁砂或铁矿石沉积区域附近的地下水源水中。水中的氢氧化铁虽然对植物没有直接危害，但由于其在灌溉系统各个组成部分中造成的沉积物，仍存在许多问题。这些沉积物形成了铁细菌生长的理想培养基，铁细菌消耗了为水培系统中植物生长提供的多种元素。
- 硬度
硬水在灌溉管，加热元件和泵中形成水垢，导致严重堵塞。像在反渗透纯化装置上游使用的防垢剂一样，使用防垢剂会降低反渗透之前的硬度。
自来水和井水中存在的有机物（除草剂）残留的除草剂会对西红柿等敏感农作物造成重要损害。活性炭过滤可以帮助减少损坏，但必须注意经常更换碳，以使其保持效率。
建议使用相对较低的TOC值，以确保有机物含量方面的水质良好。反渗透规格符合这样的建议。